Fasilitas Penelitian

Program Studi Doktor Bioteknologi bersama dengan Research Hub and Pusat Unggulan Bioteknologi Tanaman Industri (PUI-PT BioTIn), Universitas Jember  mengfasilitasi penelitian mahasiswa Doktor Bioteknologi dalam melakukan penelitian dengan laboratorium dengan fasilitas peralatan modern yang dimilik seperti:

Instrument utama

Function

New Generation sequencing

(NGS)

The Illumina MiSeq system is a next-generation sequencing (NGS) platform that enables rapid and accurate sequencing of DNA and RNA, ideal for small to medium-sized projects. It offers high-throughput sequencing with deep coverage, making it useful for applications like targeted gene sequencing, metagenomics, and small genome sequencing

Digital PCR

(ddPCR)

The QIAcuity digital PCR by Qiagen system enables precise and highly sensitive quantification of nucleic acids by partitioning samples into thousands of individual reactions. This technology is ideal for applications like rare mutation detection, gene expression analysis, and absolute quantification of DNA or RNA without the need for standard curves

Spectrophotometer UV/Vis

Spectrophotometer UV/Vis Shimadzu 1900i measures the absorbance of light across the ultraviolet and visible spectrum, allowing for precise quantification of various substances in solution. It is widely used for applications such as concentration measurements, purity assessments, and kinetic studies in fields like chemistry, biochemistry, and environmental science.

Microplate Reader With Incubator Shaker, Diode Array Absorbance, Fluorescence, and Luminescence

Fluostar Omega microplate reader, with its diode array absorbance, fluorescence, and luminescence capabilities, also functions as an advanced ELISA reader. It excels in detecting absorbance signals from ELISA assays, while its fluorescence and luminescence modes expand its utility to more sensitive detection formats, enabling high-throughput and multi-mode analysis of biomolecules with greater precision and flexibility.

Inverted Microscope with Fluorescence

Inverted Microscope Olympus IX-73 with fluorescence capability is designed for detailed imaging of live cells and tissue cultures, providing high-resolution observation from below the specimen. With integrated fluorescence functionality, it allows researchers to visualize specific proteins, organelles, or other cellular components by detecting fluorescent markers, making it ideal for applications in cell biology, molecular biology, and live-cell imaging.

Stereo Microscope

The Carl Zeiss stereo microscope offers high-quality, three-dimensional imaging of large specimens, making it ideal for tasks such as dissection, inspection, and assembly in both research and industrial settings. With excellent depth of field and magnification options, it provides precise visualization of surface details.

Encapsulator

The Buchi B-395 Pro Encapsulator is designed for the precise and reproducible production of microbeads, microspheres, and capsules using a variety of core materials and encapsulation techniques. It is commonly used in pharmaceutical, biotechnology, and food industries for applications like drug delivery, cell encapsulation, and controlled release systems, offering excellent control over particle size and encapsulation efficiency.

 

PERALATAN

KETERANGAN

Hitachi U-2900 Double Beam Spectrophotometer

Hitachi U-2900 double beam spectrophotometer merupakan salah satu instrumen yang digunakan untuk mengukur absorbansi suatu sampel. Dengan memakai Hitachi U-2900 double beam spectrophotometer, maka sampel dan blanko bisa diukur secara bersamaan sehingga lebih efisien bila dibandingkan dengan single beam. Rentang panjang gelombang antara 190 sampai 1,100 nm, dengan band pass 1.5 nm. Kecepatan Scanning meliputi 10, 100, 200, 400, 800, 1200, 2400, 3600 nm/menit. Sedangkan sumber cahaya menggunakan lampu W1 dan D2.

NanoVue Plus Spectrophotometer

NanoVue Plus spectrophotometer merupakan instrumen yang digunakan untuk pengukuran sampel asam nukleat dan protein dengan metode pengukuran langsung atau pewarnaan. Volum sampel yang diperlukan untuk pengukuran cukup sedikit yaitu antara 0.5 µL sampai 5 µL. Rentang panjang gelombang antara 200 sampai 1,100 nm, dengan spectral bandwidth 5 nm, dn dilengkapi detektor Twin CCD Array.

Corona Electric SH-1000 lab

(Microplate Reader)

Microplate reader merupakan instrumen laboratorium yang didesain untuk mendeteksi absorbansi sampel pada microtiter plates. Model pengukuran meliputi end point/single/dual wavelength Spectrum measurement Kinetic/optimal point/multi-point measurement. Rentang pengukuran absorbansi antara -0,5 sampai 3,5. Sedangkan rentang panjang gelombang antara 200 sampai 1000 nm. Plate format sesuai untuk 6,12, 24, 48, 96, 384 (flat bottom, clear).

High Speed Refrigerated Centrifuge Floor Standing

Himac CR21GIII Series merupakan jenis sentrifuse yang memiliki kecepatan rotor sampai dengan  20.000 rpm. Temperatur bisa diatur antara -20°C sampai dengan 40°C sehingga bisa digunakan untuk memisahkan sampel pada suhu dingin. Adapun macam-macam rotor yang tersedia adalah R20A2 kapasitas 100 mL x 8 pcs (20.000 rpm), R12A3 kapasitas 250 mL x 6 pcs (12.000 rpm), R3S kapasitas 1 L x 4 pcs (3000 rpm).

Microcentrifuge Floor Standing

Hitachi CF15RXII merupakan salah satu jenis sentrifuse dengan kecepatan rotor antara 0-15.000 rpm. Waktu pengoperasian alat dapat diatur  antara 5-55 detik atau 1-99 menit. Alat ini dilengkapi dengan pendingin sehingga suhu bisa diatur antara -9°C sampai dengan 40°C. Dilengkapi rotor dengan kapasitas 1,5 ml x 18 (15.000 rpm) yang bisa diautoclave.

Atomic Absorbance Spectrophotometer (AAS)

Atomic absorbancespectrophotometer (AAS) merupakan suatu instrumen yang digunakan untuk penentuan unsur kimia secara kuantitatif menggunakan absorpsi radiasi optik oleh atom bebas pada fase gas. Model ZA3000 Series Polarized Zeeman AAS merupakan suatu jenis AAS yang bisa digunakan untuk metode analisis flame photometry atauatomic absorption. Rentang panjang gelombang antara 190-900 nm. Rentang temperatur padagraphite furnace bisa diatur antara 50°C sampai 3000°C. Dilengkapi dengan 8 tempat lampu katoda yang bisa diganti dengan mudah. Lampu katoda dan larutan standar yang tersedia antara lain unsur  Na, K, Cu, Mg, Fe, Al, Ar, Zn, Pb, Cr. Sedangkan gas pembakar yang digunakan adalah gas asetilen dan argon.

PrepASH Series 340

PrepASH Series 340 merupakan suatu instrumen yang digunakan untuk analisis termo-gravimetri baik analisis kadar air, kadar abu maupun preparasi sampel untuk analisis selanjutnya. Rentang temperatur pada alat ini antara 50°C sampai dengan 1000°C. Alat ini dapat mementukan nilai kelembaban dan abu secara otomatis. Seluruh proses analisa akan dimonitor dan direkan dari awal sampai akhir. Kapasitas maksimum alat ini mencapai 120 gram. Dalam satu siklus kerja, alat ini dapat menampung 29 spesimen. Selain itu, alat ini juga dilengkapi dengan timbangan sehingga sampel bisa ditimbang secara otomatis melalui alat ini.

Rotary Evaporator

Rotary evaporator strike 300 merupakan jenis evaporator yang didesain sebagai instrumen yang aman digunakan. Dilengkapi dengan protective shield yang transparan untuk melindungi pengguna maupun lingkungan dari pergerakan dan bagian yang dipanaskan selama tahap pengoperasian alat.

Adapun spesifikasi dari alat ini adalah sebagai berikut: kecepatan rotasi antara 20 sampai 280 rpm, temperatur thermostatic bath sampai 185°C (bisa disetting untuk air dan minyak), kapasitas maksimum bath 5 liter, evaporating flask  untuk 1000 mL, collecting flask untuk 1000 mL.

Fast Protein Liquid Chromatography (FPLC)

GE AKTA Purifier 900 merupakan sistem kromatografi cair yang paling mutakhir dengan protokol aplikasi program yang luas. Alat ini didesain untuk memisahkan peptida, asam nukleat dan pemurnian protein secara cepat dan handal. GE AKTA Purifier 900 dapat digunakan untuk pemisahan protein secara cepat dengan tekanan rendah sampai sedang. Batas laju alir pada alat ini 100 ml/min, dengan batas tekanan 10 Mpa. pH monitoring antara 2-12, automated sample injection, sesuai dengan semua pelarut yang biasanya digunakan untuk kromatografi.Temperatur pengoperasian berkisar antara 4-40°C.

UV Transiluminator

UV transiluminator series memberikan sumber sinar (radiasi) ultraviolet yang seragam dan intens. Desain spesialnya memberikan satu atau dua intensitas eksitasi panjang gelombang UV untuk iluminasi belakang material transparan yang berpendar. Mode 312 nm (302 nm) disarankan untuk pemakaian gel secara umum. Mode panjang gelombang tunggal mempunyai intensitas tinggi dan rendah yang dilengkapi dengan tombol switch.

Water Bath

Shaking water bath SBS40 merupakan water bath yang dilengkapi dengan shaking yang bisa bergeraklinier maupun orbital. Pemanas diletakkan dibawah tank  untuk memudahkan pembersihan. Sensor air memberikan peringatan saat level air rendah, pemanasan akan dihentikan untuk mencegah bath tidak kering. Kecepatan dan kontrol temperatur mudah digunakan. Kecepatan shaking maupun temperatur water bath dapat diubah-ubah sesuai dengan kebutuhan dan dimonitor melalui LED display. Kapasitas alat ini mencapai 24 liter dengan rentang temperatur antara 5°C sampai 99,9°C dan kecepatan shaking antara 20 sampai 200 rpm.

BIOBASE  Laminar air flow

Meja kerja steril untuk melakukan kegiatan inokulasi/ penanaman. Alat ini digunakan dalam pekerjaan persiapan bahan tanaman, penanaman, dan pemindahan tanaman dari sutu botol ke botol yang lain dalam kultur in vitro. Alat ini meniupkan udara steril secara kontinue melewati tempat kerja sehingga tempat kerja bebas dari, debu dan spora-spora yang mungkin jatuh kedalam media, waktu pelaksanaan penanaman. Laminar Air Flow (LAF) digunakan sebagai ruangan untuk pengerjaan secara aseptiskarena juga disertai lampu UV.

Techne’s Dri-Block

Alat pemanasyangaman, kering dan sebagai sumber pemanas dengan suhu konstan di laboratorium. Unit ini sangat cocok untuk kegiatan mikrobiologi dan laboratorium klinis yang digunakan untuk inkubasi, pendidihan, inaktivasi, ashing basah, konsentrasi sampel, analisis enzim dan berbagai tujuan klinis dan industri lainnya.

The Gene Pulser Xcell™ system BioRad

Sebuah sistemelektroporasi modular untuk transfeksi setiap jenis sel. Sistem ini mencakup unit utama, kuvet ruang ShockPode ™, dan pilihan modul aksesori: capacitance extender (CE module) dan the pulse controller (PC module)

Gel imaging system

Alat yang digunakan untuk mendokumentasikan hasil  elektroforesis setelah mengalami perubahan warna dan dilihat dengan bantuan  sinar UV. Komponen alat ini terdiri dari lampu UV, kamera dan komputer. Lampu UV berfungsi menerangi bagian dalam dalam dari alat, kamera berfungsi memotret hasil elektroforesis dan komputer berfungsi menjalankan proses dokumentasi lewat bantuan software. Sistem pencitraanGel mencakup kemampuan seperti pengambilan gambar auto, analisis auto, preferensi pengguna, dan banyak fitur lainnya, membuat pencitraan gel dan analisis sangat mudah.

 Gradient Thermal PCR

Metode untuk amplifikasi (perbanyakan) primer oligonukleotida diarahkan secara enzimatik urutan DNA spesifik. Teknik ini mampu memperbanyak sebuah urutan 105-106-kali lipat dari jumlah nanogram DNA template dalam latar belakang besar pada sequence yang tidak relevan (misalnya dari total DNA genomik). PCR (Polymerase Chain Reaction) merupakan suatu teknik perbanyakan (amplifikasi) potongan DNA secara in vitro pada daerah spesifik yang dibatasi oleh dua buah primer oligonukleotida. Primer yang digunakan sebagai pembatas daerah yang diperbanyak adalah DNA untai tunggal yang urutannya komplemen dengan DNA templatnya. Proses tersebut mirip dengan proses replikasi DNA secara in vivo yang bersifat semi konservatif.

Leica EZ4 HD stereo microscope

Mikroskop stereo merupakan jenis mikroskop yang hanya bisa digunakan untuk benda yang berukuran relatif besar. Mikroskop stereo mempunyai perbesaran 7 hingga 30 kali. Benda yang diamati dengan mikroskop ini dapat terlihat secara tiga dimensi.

Terdapat kamera digital High Definition menawarkan gambar yang langsung dapat ditampilkan pada layar komputer atau layar. Perangkat lunak pencitraan secara intuitif memungkinkan dengan mudah untuk menangkap dan pengarsipan gambar.

High-Performance Liquid Chromatography (HPLC) Chromaster

Biomonitoring untuk analisis parameter organik (benzen, toluen dan xylen dalam urin sebagai metabolitnya yaitu bentuk trans-trans muconic acid, hippuric acid, methyl hippuric acid)

Analisis golongan Karbohidrat, analisis vitamin dan analisa material atau bahan obat

qPCR/Real-Time PCR Bio Rad

Perangkat instrumentasi, yang terdiri atas satu buah thermal cycler , satu buah komputer, lensa untuk eksitasi fluoresen dan pengumpul emisi, serta perangkat lunak untuk akuisisi dan analisis data. Prinsip kerjanya yakni mendeteksi dan menguantifikasi reporter fluoresen. Sinyal fluoresen akan meningkat seiring dengan bertambahnya produk PCR dalam reaksi. Dengan mencatat jumlah emisi fluoresen pada setiap siklus, reaksi selama fase eksponensial dapat dipantau.

Nitrogen Analyzer

Serangkaian instrumen nitrogen analyser yang sesuai dengan metode Kjeldahl: Buchi Speed Digester K-425/K-436dilengkapi dengan 6 glass ware sebagai tempat sampel (destriksi atau digesti), Buchi KjelFlex K-360(destilasi) dan untuk titrasi digunakan automatic ttitrator Aqua Counter COM-300A.

AutoclaveTOMY ES-315

Kapasitas 53 liter dilengkapi dengan 2 keranjang stainless steel.

Aplikasi Sterilisasi alat dan media

Aquatron Automatic Water Stills A4000

Aplikasi:  Menyuling air

Fermentor Winpact Bench-Top Fermenter FS-01-A-Series (Double Jacketed Vessel)

Mengkultur sel mamalia, mikroorganisma aerobik, mikroaerobik, anaerobik, sel serangga, sel tumbuhan, sel fotosintesis dan sel yang rapuh.

DSC (Differential Scanning Calorimeter)

Thermo plus EVO II Series High Sensitivity Differential Scanning Calorimeter DSC8230

Analisa titik lebur bahan atau material

Orbital incubator (Stuart Orbital Incubator S1600)

Membantu prosedur kultur sel, terutama kultur suspensi.

Lemari Asam Javva Fumehood FH180

Melindungi pengguna dari paparan asap berbahaya yang dilepaskan selama pengujian.